1. Descarga el fuente de Debian con la siguiente instrucción:

apt-get source squid3

2. En el directorio donde ejecutaste este comando estará descomprimido y en una carpeta el código fuente del programa que vas a reconfigurar simplemente queda accederlo:

cd squid3-VERSION/

3. Antes de aplicar la configuración nueva, también es bueno aplicar la configuración que ya tiene el squid por defecto (o cualquier otro) y agregarle lo que necesitemos, esto lo hacemos para el caso de squid3 con:

squid3 -v

Copiamos la configuración agregamos lo necesario y listo, solo la  aplicamos así:

./configure –opciones-necesarias –mas-opciones

Actualización: Disculpen pero aquí deben ingresar al directorio debian:

cd debian/

y allí ingresan al archivo rules, “vi rules” en ese es donde encontraran las opciones, para compilar sus paquetes.

En este proceso es probable que salgan algunos errores que no dejen aplicar la configuración, pero es simple resolverlos nada mas es instalar las dependencias que necesita el source, y estas las podemos   ubicar e instalar si queremos vía web en la página de Debian:

aquí les coloco los errores mas comunes y los que me salieron a mi :

ERROR: Neither SASL nor SASL2 found

Este error se soluciona instalando la siguiente dependencia “libsasl2-dev“ con:

apt-get install libsasl2-dev

y si les aparece este error:

ERROR: Cannot find cppunit at /usr

Acá realizamos lo mismo simplemente instala la dependencia necesaria, en este caso:

apt-get install libcppunit-dev

y listo si les aparece algún otro, nada mas es prestar atención a cual es la dependencia a la que puede pertenecer el error e instalarla.

una vez  se ha terminado de aplicar la configuración, armamos el paquete .deb con el siguiente comando y ubicados todavía dentro del directorio donde tenemos el fuente del squid:

dpkg-buildpackage -rfakeroot -uc -b

Cuando se termine de armar el paquete, ejecutaremos:

dpkg -i ../paquete.deb

y listo.
Espero les sirva …

mas información:

APT-HOWTO